基因編輯工具減少小鼠的阿爾茨海默病斑塊前體
一種新型基因編輯工具能夠幫助細(xì)胞機(jī)制跳過導(dǎo)致疾病的基因部分,該工具已被應(yīng)用于阿爾茨海默病小鼠模型中,以減少 β-淀粉樣蛋白斑塊前體的形成。
伊利諾伊大學(xué)厄巴納-香檳分校
12月23日
伊利諾伊大學(xué)厄巴納-香檳分校(University of Illinois at Urbana-Champaign,UIUC)的研究人員表示,該工具(稱為SPLICER)在活體小鼠中的應(yīng)用顯示了其相較于當(dāng)前基因編輯技術(shù)的標(biāo)準(zhǔn)方法具有更高的效率,以及在其他疾病中應(yīng)用的潛力。該研究成果由伊利諾伊大學(xué)的生物工程教授 Pablo Perez-Pinera 領(lǐng)導(dǎo),并發(fā)表在《自然-通訊》(Nature Communications)雜志上。
研究于2024年11月28日發(fā)表在《Nature Communications》(最新影響因子:14.7)雜志上
SPLICER 采用了一種稱為外顯子跳過的基因編輯方法,這種方法對(duì)于由產(chǎn)生錯(cuò)誤折疊或有毒蛋白質(zhì)的突變所引起的健康狀況特別感興趣,如杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良癥(Duchenne’s muscular dystrophy)或亨廷頓病(Huntington’s disease)。
Perez-Pinera 說:“DNA 包含構(gòu)建負(fù)責(zé)細(xì)胞功能的一切指令。所以它就像一本包含非常詳細(xì)的烹飪指令的食譜。但是,DNA 中有大片區(qū)域不編碼任何內(nèi)容。這就像你開始一個(gè)火雞晚餐的食譜,然后你遇到一個(gè)說明‘轉(zhuǎn)到第10頁’的標(biāo)記。第10頁之后是‘繼續(xù)在第25頁’。中間的頁面是胡言亂語。”
“但是,假設(shè)在食譜的一頁上(在遺傳學(xué)中稱為外顯子)有一個(gè)拼寫錯(cuò)誤,導(dǎo)致火雞無法食用,甚至有毒。如果我們不能直接糾正這個(gè)拼寫錯(cuò)誤,我們可以在它之前修改說明,讓你跳到下一頁,跳過有錯(cuò)誤的頁面,這樣你最終就能做出可食用的火雞。雖然你可能會(huì)錯(cuò)過被跳過的頁面上的肉汁,但你仍然有晚餐吃。同樣地,如果我們能夠跳過帶有毒性突變的基因片段,那么產(chǎn)生的蛋白質(zhì)仍然可能具有足夠的功能來發(fā)揮其關(guān)鍵作用。”
SPLICER 在流行的 CRISPR-Cas9 基因編輯平臺(tái)的基礎(chǔ)上進(jìn)行了關(guān)鍵改進(jìn)。CRISPR-Cas9 系統(tǒng)需要一個(gè)特定的 DNA 序列來附著,從而限制了可編輯的基因。而 SPLICER 使用了不需要該序列的新型 Cas9 酶,為伊利諾伊大學(xué)研究小組關(guān)注的阿爾茨海默病相關(guān)基因等新靶點(diǎn)打開了大門。
Pablo Perez-Pinera教授(中)與研究生Shraddha Shirguppe(左)和Angelo Miskalis(右)
該論文的共同第一作者、研究生 Angelo Miskalis 說:“我們?cè)诠ぷ髦?strong>解決的另一個(gè)問題是跳過的內(nèi)容的精確性。使用當(dāng)前的外顯子跳過技術(shù),有時(shí)并非所有的外顯子都會(huì)被跳過,因此我們?nèi)匀挥胁糠中蛄惺俏覀儾幌M磉_(dá)的。用食譜的類比來說,這就像試圖跳過一頁,但新頁面從中間的一句話開始,現(xiàn)在食譜就沒有意義了。我們想要避免這種情況。”
外顯子周圍有兩個(gè)關(guān)鍵的序列區(qū)域,它們告訴細(xì)胞機(jī)制使用基因的哪些部分來制造蛋白質(zhì):一個(gè)在開始處,一個(gè)在結(jié)束處。雖然大多數(shù)外顯子跳過工具只針對(duì)一個(gè)序列,但 SPLICER 會(huì)編輯起始和終止序列。因此,Miskalis 說,靶點(diǎn)外顯子被更有效地跳過了。
研究小組選擇阿爾茨海默病基因作為 SPLICER 治療能力的首次演示靶點(diǎn),因?yàn)楸M管該靶點(diǎn)基因已被廣泛研究,但在活體中實(shí)現(xiàn)高效外顯子跳過一直難以實(shí)現(xiàn)。研究人員針對(duì)一個(gè)特定的外顯子進(jìn)行編碼,該外顯子編碼蛋白質(zhì)內(nèi)的一個(gè)氨基酸序列,該序列會(huì)被切割形成 β-淀粉樣蛋白,隨著疾病的進(jìn)展,β-淀粉樣蛋白會(huì)在大腦神經(jīng)元上積聚形成斑塊。
使用SPLICER同時(shí)編輯剪接位點(diǎn)可促進(jìn)外顯子跳躍
在培養(yǎng)的神經(jīng)元中,SPLICER 有效地減少了 β-淀粉樣蛋白的形成。當(dāng)分析小鼠大腦的 DNA 和 RNA 輸出時(shí),研究人員發(fā)現(xiàn),在經(jīng) SPLICER 處理的小鼠中,靶點(diǎn)外顯子減少了 25%,且沒有證據(jù)表明存在脫靶效應(yīng)。
該研究的另一位共同第一作者、研究生 Shraddha Shirguppe 說:“當(dāng)我們最初嘗試使用舊技術(shù)靶向這個(gè)外顯子時(shí),它并沒有起作用。將新型堿基編輯器與雙重剪接編輯相結(jié)合,以比以往任何可用方法都要好得多的速率跳過了外顯子。我們能夠證明,它不僅能更好地跳過整個(gè)外顯子,還能減少這些細(xì)胞中產(chǎn)生斑塊的蛋白質(zhì)。”
Perez-Pinera 說:“如果產(chǎn)生的蛋白質(zhì)仍然具有功能,外顯子跳過才有效,因此它不能治療所有具有遺傳基礎(chǔ)的疾病。這是該方法的總體局限性。但是,對(duì)于像阿爾茨海默病、帕金森病、亨廷頓病或杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良癥這樣的疾病,這種方法具有很大的潛力。接下來的直接步驟是研究在這些疾病中去除靶點(diǎn)外顯子的安全性,并確保我們沒有創(chuàng)造出一種有毒或缺少關(guān)鍵功能的新蛋白質(zhì)。我們還需要進(jìn)行更長(zhǎng)期的動(dòng)物研究,觀察疾病是否會(huì)隨著時(shí)間的推移而進(jìn)展。”
創(chuàng)立于1867年的伊利諾伊大學(xué)厄巴納-香檳分校
參考文獻(xiàn)
Source:University of Illinois at Urbana-Champaign
Gene editing tool reduces Alzheimer’s plaque precursor in mice
Reference:
Miskalis, A., Shirguppe, S., Winter, J. et al. SPLICER: a highly efficient base editing toolbox that enables in vivo therapeutic exon skipping. Nat Commun 15, 10354 (2024). https://doi.org/10.1038/s41467-024-54529-y
關(guān)愛父母 關(guān)注阿爾茨海默病
原文標(biāo)題 : 基因編輯工具減少小鼠的阿爾茨海默病斑塊前體

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